RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488339.1

PRPSAP1-208, Transcript of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase associated protein 1, human

TSL 2

Gene PRPSAP1, Length 443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CPB2	Q96IY4	423 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	IFT74	Q96LB3	600 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	AK8	Q96MA6	479 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339		A0A0U1RQF3	1178 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TSPAN1	O60635	241 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LPXN	O60711	386 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SKI	P12755	728 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	BMPR1A	P36894	532 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FAM189B	P81408	668 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	STK38	Q15208	465 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NOTUM	Q6P988	496 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LPP	Q93052	612 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PNMA5	Q96PV4	448 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CSRNP2	Q9H175	543 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CCDC169	A6NNP5	214 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339		H3BNC9	293 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	B4GALT5	O43286	388 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HIP1R	O75146	1068 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	EOMES	O95936	686 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PLA2G4B	P0C869	781 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TXLNA	P40222	546 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NAMPT	P43490	491 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RAB27A	P51159	221 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PEX3	P56589	373 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PKP1	Q13835	747 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PPP2R5A	Q15172	486 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PTPA	Q15257	358 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PTPRO	Q16827	1216 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HYI	Q5T013	277 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LRRC43	Q8N309	656 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KIFAP3	Q92845	792 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PGBD4	Q96DM1	585 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CASD1	Q96PB1	797 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	APOL6	Q9BWW8	343 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	AAAS	Q9NRG9	546 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	F13A1	P00488	732 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RB1	P06400	928 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PLCG1	P19174	1290 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	AXL	P30530	894 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	POU5F1B	Q06416	359 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MAPK6	Q16659	721 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	EPSTI1	Q96J88	318 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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