RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.94■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 PER2O15055 1255 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 ASAP2O43150 1006 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 TECP42680 631 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 PLCB3Q01970 1234 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 RABEP1Q15276 862 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 TLE6Q9H808 572 aa20.93■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 SKIP12755 728 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 RARRES1P49788 294 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 NDUFV1P49821 464 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 TTC38Q5R3I4 469 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 GJD3Q8N144 294 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 EFHBQ8N7U6 833 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 LZTS1Q9Y250 596 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.92■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 FSCN2O14926 492 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 ZNF623O75123 536 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 MED24O75448 989 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 DGAT1O75907 488 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 OR52Z1P0C646 297 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 RAB27AP51159 221 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 NBR1Q14596 966 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 SPG21Q9NZD8 308 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 CLEC1BQ9P126 229 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.91■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 MBTPS2O43462 519 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 OFD1O75665 1012 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 GLP2RO95838 553 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 PPM1AP35813 382 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 ARL2P36404 184 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 BCAR1P56945 870 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 PTENP60484 403 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 KRT17Q04695 432 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 UBXN11Q5T124 520 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 TCF25Q9BQ70 676 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 CD207Q9UJ71 328 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 FAM50BQ9Y247 325 aa20.9■□□□□ 0.94
UPP1-211ENST00000482015 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ST18O60284 1047 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 GLRA2P23416 452 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CAPSQ13938 189 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 TFDP1Q14186 410 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 PGBD4Q96DM1 585 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 NCOR1O75376 2440 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 HIDE1A8MVS5 230 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 TSPAN1O60635 241 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 ERLIN2O94905 339 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 TRAPPC10P48553 1259 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 DUSP6Q16828 381 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 POTEGQ6S5H5 508 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 TMC7Q7Z402 723 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 CPB2Q96IY4 423 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-211ENST00000482015 RPA1P27694 616 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms