RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2-208ENST00000476817 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 LPPQ93052 612 aa23.28■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 ZNF558Q96NG5 402 aa23.28■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 CD320Q9NPF0 282 aa23.28■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 LZTS1Q9Y250 596 aa23.28■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 TBX10O75333 385 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 DGAT1O75907 488 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 OR52Z1P0C646 297 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.323e-6■□□□□ 11
CTBP2-208ENST00000476817 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 PBX3P40426 434 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 TECP42680 631 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 NRIP1P48552 1158 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 RAB27AP51159 221 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 LONRF3Q496Y0 759 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 TTC38Q5R3I4 469 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.27■■□□□ 1.32
CTBP2-208ENST00000476817 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 FSCN2O14926 492 aa23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 ST18O60284 1047 aa23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 MED24O75448 989 aa23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 ARL2P36404 184 aa23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 TRAPPC10P48553 1259 aa23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 PTENP60484 403 aa23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 EFHBQ8N7U6 833 aa23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.26■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 PPM1AP35813 382 aa23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 POU5F1BQ06416 359 aa23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 CLUL1Q15846 466 aa23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 TLE6Q9H808 572 aa23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 SPG21Q9NZD8 308 aa23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 FAM50BQ9Y247 325 aa23.25■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 ARID2Q68CP9 1835 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 PER2O15055 1255 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 OFD1O75665 1012 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 KRT17Q04695 432 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 TFDP1Q14186 410 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 NBR1Q14596 966 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 UBXN11Q5T124 520 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 CLEC1BQ9P126 229 aa23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 GLRA2P23416 452 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 NDUFV1P49821 464 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 BCAR1P56945 870 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 CAPSQ13938 189 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 GJD3Q8N144 294 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.314e-9■■□□□ 13.4
CTBP2-208ENST00000476817 PGBD4Q96DM1 585 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 TMX3Q96JJ7 454 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 NACC1Q96RE7 527 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 CD207Q9UJ71 328 aa23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 MBTPS2O43462 519 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 ERLIN2O94905 339 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 GLP2RO95838 553 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 RPA1P27694 616 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 ERMNQ8TAM6 284 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 TCF25Q9BQ70 676 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.22■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.21■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 TSPAN1O60635 241 aa23.21■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 AXLP30530 894 aa23.21■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.21■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CTBP2-208ENST00000476817 DUSP6Q16828 381 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms