RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 H0YC42 278 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 GFRA2O00451 464 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 FLOT1O75955 427 aa6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 CPB1P15086 417 aa6.51□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 CD53P19397 219 aa6.51□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.51□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 CENPHQ9H3R5 247 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.5□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 ABCC11Q96J66 1382 aa6.5□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 PZPP20742 1482 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 TEX28O15482 410 aa6.5□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 L1CAMP32004 1257 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 HSPA4P34932 840 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 MTTPP55157 894 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 NFKB2Q00653 900 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 CTBSQ01459 385 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 LRMPQ12912 555 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 IKBKEQ14164 716 aa6.5□□□□□ -1.37
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