RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 SLFN14P0C7P3 912 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 SCP2P22307 547 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCD1P33897 745 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 NDUFA8P51970 172 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 MAPK7Q13164 816 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 GIT2Q14161 759 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 MAPK6Q16659 721 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 DAW1Q8N136 415 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 MYCT1Q8N699 235 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 BSNDQ8WZ55 320 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 POLD4Q9HCU8 107 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 CHST12Q9NRB3 414 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 GAP43P17677 238 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 FGFR4P22455 802 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 AXLP30530 894 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 NPTX2P47972 431 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 MBTD1Q05BQ5 628 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 RASIP1Q5U651 963 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC65Q8IXS2 484 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TET1Q8NFU7 2136 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 MYMKA6NI61 221 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 SFI1A8K8P3 1242 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 IDEP14735 1019 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 CNNM3Q8NE01 707 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 ADAM2Q99965 735 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 MYH11P35749 1972 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.99■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 K7ERI5 159 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 LIG1P18858 919 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF131P52739 623 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 ASIC1P78348 528 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 STRN3Q13033 797 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TCTN1Q2MV58 587 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 KANK3Q6NY19 840 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC51Q96ER9 411 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TMX1Q9H3N1 280 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 RGS18Q9NS28 235 aa23.98■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 ENPP3O14638 875 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 PRKCBP05771 671 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 MYL1P05976 194 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 STAG3L1P0CL83 205 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 SKIP12755 728 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 NOTUMQ6P988 496 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 STAMQ92783 540 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIM9Q9C026 710 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.97■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 K7ENM7 598 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC16A4O15374 487 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TRAK2O60296 914 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TSPAN1O60635 241 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 AFMP43652 599 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 RAB27AP51159 221 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 UBE2HP62256 183 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM187BQ17R55 369 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 LONRF3Q496Y0 759 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 PANK4Q9NVE7 773 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
RALGPS1-212ENST00000472427 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.95■■□□□ 1.42
RALGPS1-212ENST00000472427 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.95■■□□□ 1.42
RALGPS1-212ENST00000472427 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms