RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	KIFAP3	Q92845	792 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	CHST12	Q9NRB3	414 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	CFAP45	Q9UL16	551 aa		19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	19.65	■□□□□ 0.74
USP19-210	ENST00000465902	LINC01553	A4QN01	128 aa		19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	HIP1R	O75146	1068 aa		19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	DGKI	O75912	1065 aa		19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	YEATS4	O95619	227 aa		19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	LIG1	P18858	919 aa		19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	POU5F1B	Q06416	359 aa		19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	PPP2R5A	Q15172	486 aa		19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	FIBCD1	Q8N539	461 aa		19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		19.64	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	BRD1	O95696	1058 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	GATM	P50440	423 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	SLC12A3	P55017	1021 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ADGRE1	Q14246	886 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ATL3	Q6DD88	541 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	SPRED2	Q7Z698	418 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	BSND	Q8WZ55	320 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	DRC1	Q96MC2	740 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	PANK2	Q9BZ23	570 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		19.63	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	CCDC169	A6NNP5	214 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	RFXAP	O00287	272 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	PPP6R2	O75170	966 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	FGFR1	P11362	822 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	NAMPT	P43490	491 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	PEX3	P56589	373 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	FAM189B	P81408	668 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	MCM6	Q14566	821 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	LONRF3	Q496Y0	759 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	GPBP1	Q86WP2	473 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ABI1	Q8IZP0	508 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	CPB2	Q96IY4	423 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	TRANK1	O15050	2925 aa		19.62	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902		A0A0U1RQF3	1178 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	SFI1	A8K8P3	1242 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	TSPAN1	O60635	241 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	SKI	P12755	728 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	IGFBP4	P22692	258 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ME1	P48163	572 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	RAD54L	Q92698	747 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		19.61	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	CUTA	O60888	179 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	GUCY2C	P25092	1073 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	AXL	P30530	894 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ERVK-21	P61565	698 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	MAPK6	Q16659	721 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	NOTUM	Q6P988	496 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	PDILT	Q8N807	584 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	LRRC15	Q8TF66	581 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	KCND2	Q9NZV8	630 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		19.6	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	B4GALT5	O43286	388 aa		19.59	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	HOXA2	O43364	376 aa		19.59	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	EOMES	O95936	686 aa		19.59	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	19.59	■□□□□ 0.73
USP19-210	ENST00000465902	CTNNB1	P35222	781 aa		19.59	■□□□□ 0.73

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