RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 BMT2Q1RMZ1 405 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 KIZQ2M2Z5 673 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 KSR1Q8IVT5 923 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ADSSL1Q8N142 457 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0895Q8NCT3 520 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF507Q8TCN5 953 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 HPS3Q969F9 1004 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ABHD8Q96I13 439 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ACCSQ96QU6 501 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CTAGE1Q96RT6 745 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM206Q9H813 350 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPV2Q9Y5S1 764 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-208ENST00000462602 EVPLQ92817 2033 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R37O75864 691 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 DARSP14868 501 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PRCPP42785 496 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TLE2Q04725 743 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 RBL2Q08999 1139 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM62Q0P6H9 643 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM60Q495X7 471 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM26DQ5JW98 314 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 SYCP3Q8IZU3 236 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 SCFD1Q8WVM8 642 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 FUCA2Q9BTY2 467 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 KIFC3Q9BVG8 833 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 STRA6Q9BX79 667 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TBX20Q9UMR3 447 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 GINS2Q9Y248 185 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 CDY2AQ9Y6F7 541 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 BICDL2A1A5D9 508 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PITPNM1O00562 1244 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ACKR2O00590 384 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ERLIN2O94905 339 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKCBP05771 671 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 CKBP12277 381 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.762e-6■■■□□ 16.1
SH3BP4-208ENST00000462602 CASP5P51878 434 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 MGAT3Q09327 533 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PAK1Q13153 545 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM187BQ17R55 369 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC26Q2I0M4 334 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 HS2ST1Q7LGA3 356 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP4K3Q8IVH8 894 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 NELFCDQ8IXH7 590 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 USP38Q8NB14 1042 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA5Q8TBA6 731 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 WNT8BQ93098 351 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 BICD1Q96G01 975 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 OSMRQ99650 979 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TSG101Q99816 390 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 FZD8Q9H461 694 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPY26PQ9H489 355 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 SQORQ9Y6N5 450 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 CENPFP49454 3210 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 MYH11P35749 1972 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC85CA6NKD9 419 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 PDXKO00764 312 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR182O15218 404 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 CALUO43852 315 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 CHRNA1P02708 482 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 CLTBP09497 229 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-208ENST00000462602 CTSHP09668 335 aa10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms