RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 YME1L1Q96TA2 773 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 PLIN2Q99541 437 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 CWH43Q9H720 699 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 CITO14578 2027 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 DENND3A2RUS2 1198 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJB1P25685 340 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 RFC5P40937 340 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPHP41219 470 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 RILPL1Q5EBL4 403 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 CLLU1OSQ5K130 101 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 USP49Q70CQ1 688 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF410Q86VK4 478 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 CPB2Q96IY4 423 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 MFRPQ9BY79 579 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 DOCK6Q96HP0 2047 aa7.79□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 SCLT1Q96NL6 688 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 CLIC6Q96NY7 704 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 NACC1Q96RE7 527 aa7.79□□□□□ -1.16
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RABGEF1-206ENST00000461017 PPME1Q9Y570 386 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0U1RQF3 1178 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 SFI1A8K8P3 1242 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf67F2Z3F1 127 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BNC9 293 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ASAP2O43150 1006 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 STX6O43752 255 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN1O60635 241 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 CSPG5O95196 566 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 EYA4O95677 639 aa7.78□□□□□ -1.16
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