RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 ME3Q16798 604 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBXN11Q5T124 520 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 C4orf19Q8IY42 314 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF169Q8NCN4 708 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM20AQ96MK3 541 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBP1Q9H171 429 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHST12Q9NRB3 414 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 DACT1Q9NYF0 836 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGL1Q9NZL6 768 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 DMDP11532 3685 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBX3O15119 743 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 OFD1O75665 1012 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPM1AP35813 382 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANAPC15P60006 121 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPHA7Q15375 998 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 LONRF3Q496Y0 759 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 NECAB1Q8N987 351 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 EDAQ92838 391 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYDC2Q96IM9 177 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXL18Q96ME1 805 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 NLRP4Q96MN2 994 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCLT1Q96NL6 688 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 LXNQ9BS40 222 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPG21Q9NZD8 308 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSC2P49815 1807 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 OBSL1O75147 1896 aa9.47□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 GABBR2O75899 941 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDHD2O94830 711 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLITRK3O94933 977 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 GALTP07902 379 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 TECP42680 631 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZXDAP98168 799 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDC42EP1Q00587 391 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 EMC2Q15006 297 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 KANK3Q6NY19 840 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 FERMT3Q86UX7 667 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABI1Q8IZP0 508 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTF3C6Q969F1 213 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM143Q96AN5 459 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASIC4Q96FT7 647 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGSF21Q96ID5 467 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 APOL5Q9BWW9 433 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 POMKQ9H5K3 350 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 IRAK3Q9Y616 596 aa9.46□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM186AA6NE01 2351 aa9.45□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 FSD2A1L4K1 749 aa9.45□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 JAK2O60674 1132 aa9.45□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 LILRB3O75022 631 aa9.45□□□□□ -0.9
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms