RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TEX13BQ9BXU2 312 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NAPBQ9H115 298 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 VTA1Q9NP79 307 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ERICH3Q5RHP9 1530 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KRT37O76014 449 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RBP3P10745 1247 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CCNFP41002 786 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 BBS7Q8IWZ6 715 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 PSMB7Q99436 277 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CGREF1Q99674 301 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PIK3R4Q99570 1358 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GAKO14976 1311 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM114B3SHH9 223 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SPTLC2O15270 562 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 ITGADQ13349 1161 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 XRCC4Q13426 336 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 CLVS2Q5SYC1 327 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TTC23LQ6PF05 361 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 CPA1P15085 419 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM213AQ9BRX8 229 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 ABCG4Q9H172 646 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 C5orf22Q49AR2 442 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 ADSSL1Q8N142 457 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA5Q8NB90 893 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PHKBQ93100 1093 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PANX2Q96RD6 677 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM31Q9BZY9 425 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TPK1Q9H3S4 243 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZFP69BQ9UJL9 534 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 FMN1Q68DA7 1419 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 BTBD11A6QL63 1104 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 UPP2O95045 317 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 DDX58O95786 925 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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