RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428946.5

LRRC23-204, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 969 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-204ENST00000428946 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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LRRC23-204ENST00000428946 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 TLR9Q9NR96 1032 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 PPME1Q9Y570 386 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 C5orf42Q9H799 3197 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 PER2O15055 1255 aa20.35■□□□□ 0.85
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LRRC23-204ENST00000428946 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 ERVFC1P60507 584 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 CDC42EP1Q00587 391 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 LONRF3Q496Y0 759 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.35■□□□□ 0.85
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LRRC23-204ENST00000428946 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 CD207Q9UJ71 328 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 FAM50BQ9Y247 325 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 HOXA2O43364 376 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 GLP2RO95838 553 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 RARRES1P49788 294 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 EMC2Q15006 297 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 IL17AQ16552 155 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 EFHBQ8N7U6 833 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 ERMNQ8TAM6 284 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 LPPQ93052 612 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 TLE6Q9H808 572 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 CLEC1BQ9P126 229 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.34■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 A0A0U1RQF3 1178 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 RPA1P27694 616 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 UBE3AQ05086 875 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 ECM1Q16610 540 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.33■□□□□ 0.85
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LRRC23-204ENST00000428946 POTEGQ6S5H5 508 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF410Q86VK4 478 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 MTRQ99707 1265 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 DACT1Q9NYF0 836 aa20.33■□□□□ 0.85
LRRC23-204ENST00000428946 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 PDIA5Q14554 519 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 FERMT3Q86UX7 667 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 TCP11Q8WWU5 503 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF558Q96NG5 402 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 NACC1Q96RE7 527 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 TCF25Q9BQ70 676 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.32■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 PP2D1A8MPX8 630 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 LAD1O00515 517 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 FSCN2O14926 492 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 DGAT1O75907 488 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 CDC25AP30304 524 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 PHKA2P46019 1235 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 SNX21Q969T3 373 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.31■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.3■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 PDCP20941 246 aa20.3■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 SYT1P21579 422 aa20.3■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 PRPHP41219 470 aa20.3■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LRRC23-204ENST00000428946 DUSP6Q16828 381 aa20.3■□□□□ 0.84
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