RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 TET1Q8NFU7 2136 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 H0YCG3 227 aa25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 SMTNP53814 917 aa25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 AMPD3Q01432 767 aa25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 MCM6Q14566 821 aa25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 ADAM2Q99965 735 aa25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 TMX1Q9H3N1 280 aa25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 MAGEF1Q9HAY2 307 aa25.92■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 GJB5O95377 273 aa25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 CMA1P23946 247 aa25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 ABCD1P33897 745 aa25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 SARSP49591 514 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 RAD9AQ99638 391 aa25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 LRFN2Q9ULH4 789 aa25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 INSL6Q9Y581 213 aa25.91■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 DEFB103AP81534 67 aa25.9■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 DSC3Q14574 896 aa25.9■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 NPAS4Q8IUM7 802 aa25.9■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 PDILTQ8N807 584 aa25.9■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 CCDC51Q96ER9 411 aa25.9■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.9■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 PANK2Q9BZ23 570 aa25.9■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.9■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 TLL1O43897 1013 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 PLS3P13797 630 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 MAPK6Q16659 721 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 FAM187BQ17R55 369 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 ARSHQ5FYA8 562 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 SPIRE2Q8WWL2 714 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 TNMDQ9H2S6 317 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 USP25Q9UHP3 1055 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa25.89■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 A0A1W2PQ27 194 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 A0A1W2PQ64 194 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 A0A1W2PQD8 194 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 CCDC169A6NNP5 214 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 FAM13AO94988 1023 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 RAB27AP51159 221 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 PEX3P56589 373 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 FAM189BP81408 668 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 MBTD1Q05BQ5 628 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 NOTUMQ6P988 496 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 MYLIPQ8WY64 445 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 PBX4Q9BYU1 374 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 TMEM134Q9H6X4 195 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 PARVGQ9HBI0 331 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.88■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 A0A0U1RQF3 1178 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 C9IYK1 514 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 HOXA2O43364 376 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 EOMESO95936 686 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 FGFR4P22455 802 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 DNAJB2P25686 324 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 NPTX2P47972 431 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 GIT2Q14161 759 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 CNNM3Q8NE01 707 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 LINC01599Q8WXQ3 324 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 FZD8Q9H461 694 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 TMEM161AQ9NX61 479 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 MICAL3Q7RTP6 2002 aa25.87■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 GRXCR1A8MXD5 290 aa25.86■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 K7ERI5 159 aa25.86■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 UPP2O95045 317 aa25.86■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.86■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 MAPK7Q13164 816 aa25.86■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.86■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 DAW1Q8N136 415 aa25.86■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 LRRC15Q8TF66 581 aa25.86■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 BSNDQ8WZ55 320 aa25.86■■□□□ 1.73
GLI3-202ENST00000428534 DHX58Q96C10 678 aa25.86■■□□□ 1.73
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