RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 ABCA3Q99758 1704 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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PTPRK-209ENST00000415046 ARHGAP6O43182 974 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRK-209ENST00000415046 ECE1P42892 770 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 KCNQ1P51787 676 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRK-209ENST00000415046 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 JMYQ8N9B5 988 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRK-209ENST00000415046 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 OR10A5Q9H207 317 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRK-209ENST00000415046 SLPIP03973 132 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-209ENST00000415046 ORAI2Q96SN7 254 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-209ENST00000415046 ALS2Q96Q42 1657 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 ATP7BP35670 1465 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 A0A0G2JNJ9 132 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 APPP05067 770 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 SDHAP31040 664 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 CD83Q01151 205 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.443e-6■□□□□ 10.3
PTPRK-209ENST00000415046 Q6ZSN1 163 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 BRINP3Q76B58 766 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 DLG3Q92796 817 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 MKL1Q969V6 931 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
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PTPRK-209ENST00000415046 Q9UFV3 132 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 ASB1Q9Y576 335 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 USP47Q96K76 1375 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 RGPD5Q99666 1765 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 RASSF10A6NK89 507 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 FOXP2O15409 715 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 KCNQ2O43526 872 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 PCOLCEQ15113 449 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 MIIPQ5JXC2 388 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 USP30Q70CQ3 517 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 BRAPQ7Z569 592 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 OR14A2Q96R54 314 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-209ENST00000415046 DNAJC7Q99615 494 aa6.03□□□□□ -1.44
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