RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412911.5

STX16-208, Transcript of syntaxin 16, human

TSL 4

Gene STX16, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX16-208	ENST00000412911	SCN5A	Q14524	2016 aa		18.56	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	SLC16A4	O15374	487 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	KIF20A	O95235	890 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	GCNT3	O95395	438 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	SELP	P16109	830 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	USP38	Q8NB14	1042 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	OSMR	Q99650	979 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		18.55	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	KIAA0355	O15063	1070 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	CHRNA1	P02708	482 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	CTSH	P09668	335 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	PPP1R2	P41236	205 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	MORC3	Q14149	939 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	MAPK6	Q16659	721 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	GINS2	Q9Y248	185 aa		18.54	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	LTBP2	Q14767	1821 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	DENND3	A2RUS2	1198 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911		K7ERI5	159 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	PPP1R37	O75864	691 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	GTF2B	Q00403	316 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	STRN3	Q13033	797 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	STK4	Q13043	487 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	STIM1	Q13586	685 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	FAM187B	Q17R55	369 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	STRA6	Q9BX79	667 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	TET1	Q8NFU7	2136 aa		18.53	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	BIN1	O00499	593 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	HPS3	Q969F9	1004 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	TMEM206	Q9H813	350 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	TBX20	Q9UMR3	447 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		18.52	■□□□□ 0.56
STX16-208	ENST00000412911	ERLIN2	O94905	339 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	TIMP1	P01033	207 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	PRKCB	P05771	671 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	IQCF3	P0C7M6	154 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	MYB	P10242	640 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	RFC2	P35250	354 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	CASP5	P51878	434 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	ACCS	Q96QU6	501 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	FZD8	Q9H461	694 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	DACH1	Q9UI36	760 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	GDA	Q9Y2T3	454 aa		18.51	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	ACKR2	O00590	384 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	GPR182	O15218	404 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	EVI5	O60447	810 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	RPS6KA5	O75582	802 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	RAG1	P15918	1043 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	AXL	P30530	894 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	NLRP12	P59046	1061 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	STX1A	Q16623	288 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	MLKL	Q8NB16	471 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		18.5	■□□□□ 0.55
STX16-208	ENST00000412911	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		18.5	■□□□□ 0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms