RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396667.7

TMEM106B-201, Transcript of transmembrane protein 106B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM106B, Length 12,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106B-201ENST00000396667 LRRN2O75325 713 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PTK2BQ14289 1009 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 DEFB123Q8N688 67 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RAD18Q9NS91 495 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SLC15A5A6NIM6 579 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 BRD1O95696 1058 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KIF5AQ12840 1032 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 GPM6BQ13491 265 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SURF1Q15526 300 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PTPRUQ92729 1446 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ALDH1A2O94788 518 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RHOXF2BP0C7M4 288 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 STAT1P42224 750 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SATB1Q01826 763 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SGCGQ13326 291 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 LPAL2Q16609 132 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SFR1Q86XK3 245 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NRSN1Q8IZ57 195 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KCTD6Q8NC69 237 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 USP33Q8TEY7 942 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RHOXF2Q9BQY4 288 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 LZTFL1Q9NQ48 299 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ELP1O95163 1332 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 B3GAT3O94766 335 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RPS6P62753 249 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KRT83P78385 493 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NXNQ6DKJ4 435 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 GALNT17Q6IS24 598 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TYW1BQ6NUM6 668 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RRAGAQ7L523 313 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MYOM2P54296 1465 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PEX10O60683 326 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TAF6P49848 677 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 POM121L1PQ3SYA9 428 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ERICH1Q86X53 443 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 IFNL1Q8IU54 200 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SMPD4Q9NXE4 827 aa4.77□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RFX7Q2KHR2 1363 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SNX2O60749 519 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CTSEP14091 401 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 FOXO4P98177 505 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 DNAJC24Q6P3W2 148 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CCDC149Q6ZUS6 474 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KRT86O43790 486 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 WEE2P0C1S8 567 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ORC1Q13415 861 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SFMBT2Q5VUG0 894 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 VMP1Q96GC9 406 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CLIC6Q96NY7 704 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EXO5Q9H790 373 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SGSM2O43147 1006 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 BUB1O43683 1085 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KPNA6O60684 536 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PLA2G4BP0C869 781 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PTPRAP18433 802 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 DEUP1Q05D60 604 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PLD1Q13393 1074 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TOMM20Q15388 145 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 COPS5Q92905 334 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EMILIN3Q9NT22 766 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ZSWIM5Q9P217 1185 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NAGPAQ9UK23 515 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 VPS41P49754 854 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KIF24Q5T7B8 1368 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NAA25Q14CX7 972 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TBCCQ15814 346 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PHKG1Q16816 387 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SOHLH2Q9NX45 425 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CCL16O15467 120 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SV2CQ496J9 727 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms