RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A087X1B8 175 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 KPNA6O60684 536 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAS7O60861 476 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 FSBPO95073 299 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPR158Q5T848 1215 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCSK4Q6UW60 755 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF627Q7L945 461 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 HOMER1Q86YM7 354 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 MDGA1Q8NFP4 955 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARL8AQ96BM9 186 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLIP3Q96DZ5 547 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 DRC1Q96MC2 740 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 UIMC1Q96RL1 719 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRRX2Q99811 253 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ENKD1Q9H0I2 346 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIF1Q9H611 641 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD2APQ9Y5K6 639 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 XDHP47989 1333 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 NRP1O14786 923 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 MFAP3LO75121 409 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 APOL3O95236 402 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAAP10253 952 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTGS2P35354 604 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 NPEPPSP55786 919 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q6ZPA2 131 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 C16orf86Q6ZW13 317 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRTM3Q86VH5 581 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PASD1Q8IV76 773 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 NXPE1Q8N323 547 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 MB21D1Q8N884 522 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDYL2Q8N8U2 506 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIK3C3Q8NEB9 887 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHTF18Q8WVB6 975 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 NINJ1Q92982 152 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 MNTQ99583 582 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 MTFR1LQ9H019 292 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 IFT57Q9NWB7 429 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYPNQ86TC9 1320 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 TGM5O43548 720 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PFKMP08237 780 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRT4P19013 534 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PHC1P78364 1004 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 TKFCQ3LXA3 575 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 RABL3Q5HYI8 236 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMC1BQ8NDV3 1235 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ST8SIA2Q92186 375 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 APPBP2Q92624 585 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 LENG9Q96B70 501 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 NCDNQ9UBB6 729 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 STC2O76061 302 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALDH1A2O94788 518 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDH8O95206 1070 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 GNAT2P19087 354 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPR15P49685 360 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 NEK4P51957 841 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 WNT3AP56704 352 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC178Q5BJE1 867 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 METTL24Q5JXM2 366 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPM1KQ8N3J5 372 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF610Q8N9Z0 462 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 FERMT2Q96AC1 680 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDCD2LQ9BRP1 358 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 ING3Q9NXR8 418 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 MSRAQ9UJ68 235 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIM24O15164 1050 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-601P-201ENST00000384540 NRP2O60462 931 aa3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms