RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 AGAP11Q8TF27 550 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 SAMD11Q96NU1 681 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 AFF2P51816 1311 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.32□□□□□ -1.24
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