RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 CHKBQ9Y259 395 aa23.41■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 NCANO14594 1321 aa23.4■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 TSPY2A6NKD2 308 aa23.4■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 TAC1P20366 129 aa23.4■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PRELID2Q8N945 189 aa23.4■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 PNMA1Q8ND90 353 aa23.4■■□□□ 1.34
OPN3-201ENST00000366554 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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OPN3-201ENST00000366554 FOXN2P32314 431 aa23.38■■□□□ 1.33
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OPN3-201ENST00000366554 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.37■■□□□ 1.33
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OPN3-201ENST00000366554 TMEM253P0C7T8 217 aa23.37■■□□□ 1.33
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OPN3-201ENST00000366554 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.37■■□□□ 1.33
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OPN3-201ENST00000366554 COL18A1P39060 1754 aa23.37■■□□□ 1.33
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OPN3-201ENST00000366554 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.36■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 PTPRN2Q92932 1015 aa23.36■■□□□ 1.33
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OPN3-201ENST00000366554 POTEJP0CG39 1038 aa23.36■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 SKIP12755 728 aa23.36■■□□□ 1.33
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OPN3-201ENST00000366554 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.36■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 SIX2Q9NPC8 291 aa23.36■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.36■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 ATP9AO75110 1047 aa23.35■■□□□ 1.33
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OPN3-201ENST00000366554 TTLL1O95922 423 aa23.35■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 GIT2Q14161 759 aa23.35■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.35■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
OPN3-201ENST00000366554 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.35■■□□□ 1.33
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