RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365172.1

SNORD49B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 49B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD49B, Length 72 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD49B-201ENST00000365172 UPK3BL1B0FP48 263 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 UPK3BL2E5RIL1 263 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 H0Y8X5 98 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 MEIS1O00470 390 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PPEF2O14830 753 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 WNT9AO14904 365 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SHOXO15266 292 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LINC01565O15544 149 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC26A4O43511 780 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LPXNO60711 386 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DNAJA2O60884 412 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CBFA2T3O75081 653 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TADA3O75528 432 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM155BO75949 473 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DDNO94850 711 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 UBOX5O94941 541 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 OAZ2O95190 189 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ESRRBO95718 433 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LATS1O95835 1130 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TOMM40O96008 361 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LRG1P02750 347 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PRKCGP05129 697 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GSNP06396 782 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 UMODP07911 640 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GSTM1P09488 218 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PRR35P0CG20 571 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 HKR1P10072 659 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 IFNGR1P15260 489 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 WT1P19544 449 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 NR1D1P20393 614 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LTBRP36941 435 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 NR4A2P43354 598 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TNNI2P48788 182 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CXCR3P49682 368 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 HTR6P50406 440 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CACNA2D1P54289 1103 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FCGRTP55899 365 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DEFA6Q01524 100 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 HGFACQ04756 655 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 MPP3Q13368 585 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ORC1Q13415 861 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ADAM15Q13444 863 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SEPT6Q14141 434 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SEMA3AQ14563 771 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 MCM6Q14566 821 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP0.03□□□□□ -2.42e-27■■□□□ 12.1
SNORD49B-201ENST00000365172 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LLGL1Q15334 1064 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LEXMQ3ZCV2 418 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TIGD2Q4W5G0 525 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 XKR4Q5GH76 650 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FKBP15Q5T1M5 1219 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PCNX4Q63HM2 1172 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC9A4Q6AI14 798 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 RCSD1Q6JBY9 416 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ALKBH2Q6NS38 261 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TMC5Q6UXY8 1006 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TPTE2Q6XPS3 522 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TAOK1Q7L7X3 1001 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 NEK8Q86SG6 692 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CUZD1Q86UP6 607 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ARHGEF25Q86VW2 580 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 RIOX2Q8IUF8 465 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 AEBP1Q8IUX7 1158 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ARHGEF19Q8IW93 802 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 Q8N1Y9 231 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SHCBP1Q8NEM2 672 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TTLL11Q8NHH1 800 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CAGE1Q8TC20 777 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM200AQ8TCP9 573 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PLEKHO2Q8TD55 490 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 HASPINQ8TF76 798 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DNASE2BQ8WZ79 361 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DDB2Q92466 427 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CAVIN3Q969G5 261 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SARAFQ96BY9 339 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 MIEF2Q96C03 454 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF524Q96C55 264 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 HMCESQ96FZ2 354 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms