RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 PMM2O15305 246 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 AP1G1O43747 822 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 KRT37O76014 449 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 VAV1P15498 845 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PRELPP51888 382 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ERAP2Q6P179 960 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 NME9Q86XW9 330 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PAF1Q8N7H5 531 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TCTN2Q96GX1 697 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TEKT5Q96M29 485 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 RNF38Q9H0F5 515 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CSRNP2Q9H175 543 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ADCY9O60503 1353 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 NFAT5O94916 1531 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CD53P19397 219 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SERPINB3P29508 390 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 GPR3P46089 330 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 GTF2A2P52657 109 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 AK2P54819 239 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 FSTL1Q12841 308 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 LSAMPQ13449 338 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ANO1Q5XXA6 986 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 IP6K1Q92551 441 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CASS4Q9NQ75 786 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CBLCQ9ULV8 474 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 ITGB5P18084 799 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 GDNFP39905 211 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 HK2P52789 917 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 GALEQ14376 348 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ACAP3Q96P50 834 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TAAR9Q96RI9 348 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 MYD88Q99836 296 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TOMM22Q9NS69 142 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 COL18A1P39060 1754 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RGPD5Q99666 1765 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 HIP1RO75146 1068 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ZNF205O95201 554 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PAPLNO95428 1278 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SYPP08247 313 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 MMP10P09238 476 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RHCEP18577 417 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SLC9A1P19634 815 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 AFMP43652 599 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TGFB2P61812 414 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 IRF9Q00978 393 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RHDQ02161 417 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TEKQ02763 1124 aa6.7□□□□□ -1.34
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