RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 FMO5P49326 533 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 NPEPPSP55786 919 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.851e-10■■■■■ 28.4
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SH3BP1-201ENST00000357436 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT14P02533 472 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 SOX5P35711 763 aa20.37■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 GUCY2FP51841 1108 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 CD302Q8IX05 232 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 KLRG1Q96E93 195 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 STK33Q9BYT3 514 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 ISCUQ9H1K1 167 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF146Q9NTX7 359 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 19.1
SH3BP1-201ENST00000357436 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 LMNB1P20700 586 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 ERVK-9P63128 1117 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 PEX26Q7Z412 305 aa20.36■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 GNGT1P63211 74 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 DCAF15Q66K64 600 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.36■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 SYT11Q9BT88 431 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 FSTL1Q12841 308 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 MTMR1Q13613 665 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 TREML2Q5T2D2 321 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 PPM1EQ8WY54 764 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 FAM107BQ9H098 131 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 SOX10P56693 466 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 EMC10Q5UCC4 262 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 HES6Q96HZ4 224 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 CUL1Q13616 776 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 VGLL4Q14135 290 aa20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 PPP2R5AQ15172 486 aa20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 GPC2Q8N158 579 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP1-201ENST00000357436 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC188H7C350 402 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 EBAG9O00559 213 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2G6O60733 806 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 GUCY2CP25092 1073 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 ODR4Q5SWX8 454 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 DAAM2Q86T65 1068 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 RDH13Q8NBN7 331 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-201ENST00000357436 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.33■□□□□ 0.85
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