RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 NEDD9Q14511 834 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM58Q8NG06 486 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 H0YHG0 523 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CLIC2O15247 247 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.831e-8■■■□□ 17.8
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SPNS1-204ENST00000352260 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.25■□□□□ 0.83
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SPNS1-204ENST00000352260 NFASCO94856 1347 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM150BA6NC51 233 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 BACH1O14867 736 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 AKAP3O75969 853 aa20.24■□□□□ 0.83
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SPNS1-204ENST00000352260 NFIL3Q16649 462 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 KSR1Q8IVT5 923 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CDHR1Q96JP9 859 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 STRA6Q9BX79 667 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 SNX12Q9UMY4 172 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 PPIL2Q13356 520 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CD302Q8IX05 232 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 DNERQ8NFT8 737 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 IWS1Q96ST2 819 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 EPN3Q9H201 632 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO40Q9UH90 709 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 SUFUQ9UMX1 484 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R37O75864 691 aa20.23■□□□□ 0.83
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SPNS1-204ENST00000352260 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CASP4P49662 377 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CNTN2Q02246 1040 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 KCNH2Q12809 1159 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 GNPTABQ3T906 1256 aa20.23■□□□□ 0.83
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SPNS1-204ENST00000352260 BAP1Q92560 729 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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SPNS1-204ENST00000352260 PFASO15067 1338 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 SRGAP2O75044 1071 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CNMDO75829 334 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 C1QTNF8P60827 252 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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SPNS1-204ENST00000352260 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 MYH11P35749 1972 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CEP350Q5VT06 3117 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 K7ENM7 598 aa20.21■□□□□ 0.83
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SPNS1-204ENST00000352260 NOL4O94818 638 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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SPNS1-204ENST00000352260 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 XKR9Q5GH70 373 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 PDXDC1Q6P996 788 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CREG2Q8IUH2 290 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 MREGQ8N565 214 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 TIPINQ9BVW5 301 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC53A6NM62 1247 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 TACC1O75410 805 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 PLS3P13797 630 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 NPEPPSP55786 919 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 KIF5AQ12840 1032 aa20.21■□□□□ 0.83
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