RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342784.6

SYDE1-201, Transcript of synapse defective Rho GTPase homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SYDE1, Length 3,264 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1-201ENST00000342784 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 NR2E1Q9Y466 385 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 LAD1O00515 517 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 ATP9AO75110 1047 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 ZNF365Q70YC5 407 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 NAGPAQ9UK23 515 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 SLC5A1P13866 664 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 BRAFP15056 766 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 EPHB2P29323 1055 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 KLRC3Q07444 240 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 RASGRF1Q13972 1273 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 GALNT8Q9NY28 637 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 SLIT2O94813 1529 aa14.72□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 ACSL3O95573 720 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 VCAM1P19320 739 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 RNF43Q68DV7 783 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 SLC35B4Q969S0 331 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 PREBQ9HCU5 417 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 OCEL1Q9H607 264 aa14.71□□□□□ -0.05
SYDE1-201ENST00000342784 MYH1P12882 1939 aa14.71□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 MYMKA6NI61 221 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 RIPK2O43353 540 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 NME8Q8N427 588 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 USP40Q9NVE5 1235 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 MAPK13O15264 365 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PFDN1O60925 122 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 CREB1P16220 341 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 CALCOCO2Q13137 446 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 MAPK7Q13164 816 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 CCNJLQ8IV13 435 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 INTUQ9ULD6 942 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PROM2Q8N271 834 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 STMN2Q93045 179 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PDP2Q9P2J9 529 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 RPTORQ8N122 1335 aa14.7□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 ABCB4P21439 1286 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 TXKP42681 527 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 STRN3Q13033 797 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 ZWILCHQ9H900 591 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 C5P01031 1676 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 TNS2Q63HR2 1409 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 A0A1W2PRG0 241 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 NMT2O60551 498 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 ACTN1P12814 892 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 PLCG2P16885 1265 aa14.69□□□□□ -0.06
SYDE1-201ENST00000342784 GM2AP17900 193 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms