RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 COG5Q9UP83 839 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 GMNCA6NCL1 334 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 E7EVH7 732 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 CFBP00751 764 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 VCAM1P19320 739 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 ABCB4P21439 1286 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 TLCD1Q96CP7 247 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 AGPAT1Q99943 283 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 TMX2Q9Y320 296 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 NUDT17P0C025 328 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 BCRP11274 1271 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 DRP2Q13474 957 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 ALCAMQ13740 583 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 PALB2Q86YC2 1186 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 DAW1Q8N136 415 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 DPH5Q9H2P9 285 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXD1-201ENST00000331462 C5orf60A6NFR6 353 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 EXOC3O60645 756 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 PLA2G6O60733 806 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 PLCB4Q15147 1175 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ALG3Q92685 438 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 RIT2Q99578 217 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 LXNQ9BS40 222 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 USP20Q9Y2K6 914 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 HIP1RO75146 1068 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 CSRNP1Q96S65 589 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 GOPCQ9HD26 462 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 MTA2O94776 668 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 KRT13P13646 458 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 GBP1P32455 592 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 KRT71Q3SY84 523 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 HOOK3Q86VS8 718 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 BANK1Q8NDB2 785 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 PSMD1Q99460 953 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 EPB41L4BQ9H329 900 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 PMM2O15305 246 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 PHF2O75151 1096 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 GGPS1O95749 300 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ARP10275 920 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 MYH11P35749 1972 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ECE1P42892 770 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 EPC2Q52LR7 807 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 JAMLQ86YT9 394 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM206Q9H813 350 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ALG6Q9Y672 507 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 MAPK13O15264 365 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 CETN1Q12798 172 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 MORC4Q8TE76 937 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 CENPTQ96BT3 561 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 HOOK2Q96ED9 719 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 CHRNA3P32297 505 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 USP8P40818 1118 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ZDHHC24Q6UX98 284 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD1-201ENST00000331462 EMSYQ7Z589 1322 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms