RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.5□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 CAND2O75155 1236 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 FAM187BQ17R55 369 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 TBX20Q9UMR3 447 aa6.49□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 COL6A1P12109 1028 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 SPATA1Q5VX52 437 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 TTI2Q6NXR4 508 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 NELFBQ8WX92 580 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 MED15Q96RN5 788 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TSG101Q99816 390 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDE4D-202ENST00000317118 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 POLD4Q9HCU8 107 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 DENND3A2RUS2 1198 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 SLC16A4O15374 487 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-202ENST00000317118 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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