RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 PER2O15055 1255 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 DCXO43602 365 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 FOSBP53539 338 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 EMC2Q15006 297 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 DUSP6Q16828 381 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 TMC7Q7Z402 723 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM169Q96HH4 297 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 CLEC1BQ9P126 229 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF623O75123 536 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 SLITRK3O94933 977 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 PBX3P40426 434 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 TXKP42681 527 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 BCAR1P56945 870 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 TFDP1Q14186 410 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 RNF149Q8NC42 400 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC9B-201ENST00000311308 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 DGAT1O75907 488 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 ERLIN2O94905 339 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 LYPLA2O95372 231 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 GLP2RO95838 553 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 FERMT3Q86UX7 667 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 URGCPQ8TCY9 931 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 C8orf76Q96K31 380 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 SEC24BO95487 1268 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 CA8P35219 290 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 CNNM3Q8NE01 707 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 LPPQ93052 612 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 PRR33A8MZF0 331 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 ATP2B1P20020 1258 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 LONRF3Q496Y0 759 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 STK39Q9UEW8 545 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 HIDE1A8MVS5 230 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 ZBTB39O15060 712 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 OFD1O75665 1012 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 AXLP30530 894 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 MCM7P33993 719 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 TECP42680 631 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 GIT2Q14161 759 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 CASP10Q92851 521 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC51Q96ER9 411 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 MTMR9Q96QG7 549 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 RSAD1Q9HA92 442 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.47■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 PTENP60484 403 aa22.47■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 GUCY1B3Q02153 619 aa22.47■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 POU5F1BQ06416 359 aa22.47■■□□□ 1.19
TTC9B-201ENST00000311308 ST3GAL1Q11201 340 aa22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms