RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294161.10

TTC9C-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC9C, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9C-201ENST00000294161 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 VAMP7P51809 220 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 NCKAP1LP55160 1127 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PLS1Q14651 629 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 RPS6KA1Q15418 735 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 GNPTABQ3T906 1256 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MAEAQ7L5Y9 396 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 USP37Q86T82 979 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 KLRG1Q96E93 195 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 TEX13BQ9BXU2 312 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MED4Q9NPJ6 270 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 H0YCG3 227 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PMM2O15305 246 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 ACAD9Q9H845 621 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 NENFQ9UMX5 172 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 NFASCO94856 1347 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 NCK2O43639 380 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 EVI5O60447 810 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 SCP2P22307 547 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 DGKZQ13574 1117 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CST9Q5W186 159 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 REPS2Q8NFH8 660 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 BACH1O14867 736 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 TRIM49P0CI25 452 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 TRIM49CP0CI26 452 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 TNFAIP3P21580 790 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 NF2P35240 595 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 HMGCS2P54868 508 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PEX3P56589 373 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 VGLL4Q14135 290 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CBWD6Q4V339 395 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 C8orf74Q6P047 294 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MCPH1Q8NEM0 835 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 ATP9AO75110 1047 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 FTCDO95954 541 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CCNE2O96020 404 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CXCR5P32302 372 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 TNNC1P63316 161 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 ENPEPQ07075 957 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 FAM71BQ8TC56 605 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 ELP3Q9H9T3 547 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 USP20Q9Y2K6 914 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 TRPM7Q96QT4 1865 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 SLC16A4O15374 487 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 TNFRSF8P28908 595 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 RTP1P59025 263 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 KIF22Q14807 665 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 UGCGQ16739 394 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 GJB7Q6PEY0 223 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 IFT20Q8IY31 132 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 RDH13Q8NBN7 331 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PSMB7Q99436 277 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PDE11AQ9HCR9 933 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 KMT5AQ9NQR1 393 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 STIM2Q9P246 746 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 TBX20Q9UMR3 447 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MYH10P35580 1976 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 EMSYQ7Z589 1322 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CCDC169A6NNP5 214 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 KIF4AO95239 1232 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 TMEM253P0C7T8 217 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CLUL1Q15846 466 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CHST13Q8NET6 341 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 CEP170P1Q96L14 293 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 IFT74Q96LB3 600 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TTC9C-201ENST00000294161 ST7Q9NRC1 585 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms