RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 DEPTORQ8TB45 409 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 FIZ1Q96SL8 496 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 PADI3Q9ULW8 664 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 PTPRSQ13332 1948 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 TTC3P53804 2025 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 TRAK2O60296 914 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 IDEP14735 1019 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 SCP2P22307 547 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 CD52P31358 61 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 EFNA5P52803 228 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 SMTNP53814 917 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 EPHB4P54760 987 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 ASIC1P78348 528 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 EHHADHQ08426 723 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 FAM187BQ17R55 369 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 UNC13DQ70J99 1090 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 MYCT1Q8N699 235 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 SEPT8Q92599 483 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 PANK4Q9NVE7 773 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 DACT1Q9NYF0 836 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC169A6NNP5 214 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 H0YCG3 227 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 KLRC4O43908 158 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 CASP1P29466 404 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 MCM4P33991 863 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 DPYDQ12882 1025 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 COASYQ13057 564 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 POSTNQ15063 836 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 AMHR2Q16671 573 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM240Q5SV17 173 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 SFR1Q86XK3 245 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 FZD8Q9H461 694 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 SLC16A4O15374 487 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 BAIAP3O94812 1187 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 PRR29P0C7W0 189 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 ACRP10323 421 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 ABCD1P33897 745 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 BMP8BP34820 402 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 MAPK6Q16659 721 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 TCTN1Q2MV58 587 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF365Q70YC5 407 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 TMX1Q9H3N1 280 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC42-201ENST00000293845 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 K7ENM7 598 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ACKR2O00590 384 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN1O60635 241 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 EFCAB14O75071 495 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R37O75864 691 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ERLIN2O94905 339 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 FGBP02675 491 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 PRKCBP05771 671 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ACTN1P12814 892 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 FGFR4P22455 802 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 AXLP30530 894 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 GTF2BQ00403 316 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 IKBKEQ14164 716 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 DSC3Q14574 896 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 HERVK_113Q902F9 699 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC42-201ENST00000293845 STRA6Q9BX79 667 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms