RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 MYH15Q9Y2K3 1946 aa27.84■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 SLC26A4O43511 780 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 SKIP12755 728 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 MBTD1Q05BQ5 628 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 PPP2R5AQ15172 486 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 TMEM119Q4V9L6 283 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 ABI1Q8IZP0 508 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 BSNDQ8WZ55 320 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 KIFAP3Q92845 792 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 IFT74Q96LB3 600 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 RUSC1Q9BVN2 902 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 CSRNP2Q9H175 543 aa27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
PDF-201ENST00000288022 TSPAN1O60635 241 aa27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 EOMESO95936 686 aa27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 F13A1P00488 732 aa27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 RAB27AP51159 221 aa27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 STK38Q15208 465 aa27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 RINT1Q6NUQ1 792 aa27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 DEPTORQ8TB45 409 aa27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 TRAIPQ9BWF2 469 aa27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 FAM105AQ9NUU6 356 aa27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 AXLP30530 894 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 BMPR1AP36894 532 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 NAMPTP43490 491 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 BECN1Q14457 450 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 SLC39A14Q15043 492 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 KARSQ15046 597 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 LONRF3Q496Y0 759 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 SPECC1Q5M775 1068 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CPB2Q96IY4 423 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 TMEM117Q9H0C3 514 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 C2orf40Q9H1Z8 148 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 MYO9BQ13459 2157 aa27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 LPXNO60711 386 aa27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 HIP1RO75146 1068 aa27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 PLA2G4BP0C869 781 aa27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 GPM6BQ13491 265 aa27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 PKP1Q13835 747 aa27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 NOTUMQ6P988 496 aa27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 C1orf186Q6ZWK4 172 aa27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CLIC6Q96NY7 704 aa27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.8■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 LINC00271P0C7V0 271 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 LIG1P18858 919 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 PLCG1P19174 1290 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 HELQQ8TDG4 1101 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 LPPQ93052 612 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 EPSTI1Q96J88 318 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 DRC1Q96MC2 740 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 RNF19AQ9NV58 838 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CDH23Q9H251 3354 aa27.79■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 H3BNC9 293 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 B4GALT5O43286 388 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 RB1P06400 928 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 TXLNAP40222 546 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 SLC12A3P55017 1021 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 AMHR2Q16671 573 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 TMEM132AQ24JP5 1023 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CLLU1OSQ5K130 101 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 PGBD4Q96DM1 585 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CASD1Q96PB1 797 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 TIPINQ9BVW5 301 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CCSER1Q9C0I3 900 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 KIAA1671Q9BY89 1806 aa27.78■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CHD7Q9P2D1 2997 aa27.77■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CCDC169A6NNP5 214 aa27.77■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 C5orf67F2Z3F1 127 aa27.77■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 UBXN11Q5T124 520 aa27.77■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 USP49Q70CQ1 688 aa27.77■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 LINC00301Q8NCQ3 95 aa27.77■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 CCDC51Q96ER9 411 aa27.77■■■□□ 2.04
PDF-201ENST00000288022 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms