RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.25■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 A0A087X0B3 334 aa23.25■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 DCTN4Q9UJW0 460 aa23.25■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 SLC37A4O43826 429 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 CCNYQ8ND76 341 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 ARL8AQ96BM9 186 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 APOL6Q9BWW8 343 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 ADAM33Q9BZ11 813 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PSAPP07602 524 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 FGFR2P21802 821 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 CDO1Q16878 200 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 DIP2BQ9P265 1576 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 CEP55Q53EZ4 464 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 LRRC31Q6UY01 552 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 SMYD2Q9NRG4 433 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 ZNF446Q9NWS9 450 aa23.24■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PSMA2P25787 234 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 FMO5P49326 533 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 STK33Q9BYT3 514 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 WDR64B1ANS9 1081 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 TOM1L1O75674 476 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PARP9Q8IXQ6 854 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 IL17RAQ96F46 866 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 CCND2P30279 289 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 CFAP36Q96G28 342 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.23■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 COPB2P35606 906 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 GJB7Q6PEY0 223 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PFASO15067 1338 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 MED10Q9BTT4 135 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 ITSN1Q15811 1721 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 BMP6P22004 513 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 GRB10Q13322 594 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 BCAP29Q9UHQ4 241 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 MEGF6O75095 1541 aa23.22■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 KCNJ1P48048 391 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 CORO7P57737 925 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 KRT17Q04695 432 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 HSPH1Q92598 858 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 NLRP4Q96MN2 994 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 LRRC37BQ96QE4 947 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PRPSAP2O60256 369 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 CHN1P15882 459 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 MARK3P27448 753 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 GPS1Q13098 491 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 TRIM42Q8IWZ5 723 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 TCP11X1B4DZS4 312 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 NDUFB10O96000 172 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 RNF169Q8NCN4 708 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 MASTLQ96GX5 879 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 HAUS2Q9NVX0 235 aa23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP12-201ENST00000282344 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms