RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 DPH6Q7L8W6 267 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRO-201ENST00000281171 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRO-201ENST00000281171 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRO-201ENST00000281171 TTC25Q96NG3 672 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRO-201ENST00000281171 M0R3G1 203 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CBFA2T3O75081 653 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TNNC2P02585 160 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TFDP1Q14186 410 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 P2RX5Q93086 422 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PGBD1Q96JS3 809 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PARVGQ9HBI0 331 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ABLIM1O14639 778 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ASNA1O43681 348 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SP4Q02446 784 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ALCAMQ13740 583 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SENP1Q9P0U3 644 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 O00370 1275 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CBX3Q13185 183 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SLFN13Q68D06 897 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RNF34Q969K3 372 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TUBA4AP68366 448 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PLD3Q8IV08 490 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 WDR19Q8NEZ3 1342 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 COPEO14579 308 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 POTEAQ6S8J7 498 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TNIP2Q8NFZ5 429 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RWDD3Q9Y3V2 267 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ESYT2A0FGR8 921 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 NSFP46459 744 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CDH24Q86UP0 819 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 GIPC2Q8TF65 315 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 GALNT8Q9NY28 637 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KLHL33A6NCF5 533 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 GOLGA8CPA6NN73 597 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 LPXNO60711 386 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KIF22Q14807 665 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RINT1Q6NUQ1 792 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 MED14O60244 1454 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 EXOC3L4Q17RC7 722 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RNF207Q6ZRF8 634 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KCNK16Q96T55 309 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 LIFRP42702 1097 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ATP1A4Q13733 1029 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PPP2R5DQ14738 602 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 FAM129AQ9BZQ8 928 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 L3MBTL1Q9Y468 752 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TTLL1O95922 423 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ADD2P35612 726 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 POTEFA5A3E0 1075 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TAF4O00268 1085 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 GSTA4O15217 222 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 WDR47O94967 919 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PSEN1P49768 467 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 FAM26FQ5R3K3 315 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 HEATR4Q86WZ0 1026 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PPP2R3CQ969Q6 453 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 NDNQ99608 321 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KRT37O76014 449 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KYNUQ16719 465 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms