RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 XKR9Q5GH70 373 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM50Q86XT4 487 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 KCND2Q9NZV8 630 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 LGR5O75473 907 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 PRCPP42785 496 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 STAT5BP51692 787 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA1Q5VX52 437 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 FAM212AQ96EL1 285 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 TNFAIP2Q03169 654 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 XKR3Q5GH77 459 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 OATP04181 439 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 PPTC7Q8NI37 304 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 AFG1LQ8WV93 481 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 AZI2Q9H6S1 392 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 EMSYQ7Z589 1322 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 CEP170P1Q96L14 293 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 WDR93Q6P2C0 686 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 GLG1Q92896 1179 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 HSPA6P17066 643 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 CASP14P31944 242 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 SFR1Q86XK3 245 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 ADSSL1Q8N142 457 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 SFI1A8K8P3 1242 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 MAPK7Q13164 816 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 PSMD2Q13200 908 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 TRPV1Q8NER1 839 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 SRRDQ9UH36 339 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 HIP1RO75146 1068 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 MARK3P27448 753 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 GGCXP38435 758 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 PBX1P40424 430 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 IRAK1P51617 712 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 DAW1Q8N136 415 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 MYH11P35749 1972 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 CENPFP49454 3210 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 MFAP3LO75121 409 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 FAM13AO94988 1023 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 STIM1Q13586 685 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 MTERF2Q49AM1 385 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 ABL1P00519 1130 aa22.14■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 CYBAP13498 195 aa22.14■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF131P52739 623 aa22.14■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.14■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.14■■□□□ 1.14
UBE2B-201ENST00000265339 HTTP42858 3142 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 LGALS2P05162 132 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 MMP3P08254 477 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM32Q13049 653 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC41Q15345 812 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 GBP6Q6ZN66 633 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 NELFBQ8WX92 580 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 TSKSQ9UJT2 592 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 FKTNO75072 461 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 GYPCP04921 128 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2B-201ENST00000265339 PAK1Q13153 545 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms