RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 TCP11Q8WWU5 503 aa23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 PGBD4Q96DM1 585 aa23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM169Q96HH4 297 aa23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 LXNQ9BS40 222 aa23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 ASAP2O43150 1006 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 DTNBO60941 627 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 SUSD6Q92537 303 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 RGL1Q9NZL6 768 aa23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 NR5A1Q13285 461 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 ME3Q16798 604 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 NECAB1Q8N987 351 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 EDAQ92838 391 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 LPPQ93052 612 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 GTF3C6Q969F1 213 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM143Q96AN5 459 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 DYDC2Q96IM9 177 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 S1PR5Q9H228 398 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 LONRF3Q496Y0 759 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 XKR9Q5GH70 373 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 CASP10Q92851 521 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 C5orf42Q9H799 3197 aa23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 OFD1O75665 1012 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 SLITRK3O94933 977 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 CXCL14O95715 111 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 SYCE2Q6PIF2 218 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 TPH2Q8IWU9 490 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 TNFRSF25Q93038 417 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 MFSD14AQ96MC6 490 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 FAM205CA6NFA0 338 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 CA8P35219 290 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 NEK4P51957 841 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 CYP4A11Q02928 519 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM29Q14134 588 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 GIT2Q14161 759 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 EMC2Q15006 297 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 FERMT3Q86UX7 667 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 VPS52Q8N1B4 723 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 MTRQ99707 1265 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 GALTP07902 379 aa23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 CALCRLQ16602 461 aa23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 RNF149Q8NC42 400 aa23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 URGCPQ8TCY9 931 aa23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 IGSF21Q96ID5 467 aa23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 KCNH6Q9H252 994 aa23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 BTBD18B2RXH4 712 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB39O15060 712 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 LYPLA2O95372 231 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 LARGE1O95461 756 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 CES5AQ6NT32 575 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 CNNM3Q8NE01 707 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-201ENST00000250495 APOL5Q9BWW9 433 aa23.48■■□□□ 1.35
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