RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000232888.6

RRP9-201, Transcript of ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRP9, Length 1,578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9-201ENST00000232888 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 HSPBP1Q9NZL4 362 aa26■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 TRPC6Q9Y210 931 aa26■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 ZBTB42B2RXF5 422 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 TUBB4AP04350 444 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 GARTP22102 1010 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 ENPEPQ07075 957 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 STRN3Q13033 797 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 NOGQ13253 232 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 CEP72Q9P209 647 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 GJD2Q9UKL4 321 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 COL1A2P08123 1366 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 EFNA5P52803 228 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 TNFAIP2Q03169 654 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 CBWD1Q9BRT8 395 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.99■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 PIGRP01833 764 aa25.98■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 BFSP1Q12934 665 aa25.98■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 GBP6Q6ZN66 633 aa25.98■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.98■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.98■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 MAGEB2O15479 319 aa25.97■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 ASAP2O43150 1006 aa25.97■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 ADCY3O60266 1144 aa25.97■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 IGHA2P01877 340 aa25.97■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 DGKDQ16760 1214 aa25.97■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.97■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.97■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 K7ERI5 159 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 TAS1R3Q7RTX0 852 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 FBXL18Q96ME1 805 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 KIAA1586Q9HCI6 787 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 FBXL5Q9UKA1 691 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 Q9Y3F1 56 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 STYXL1Q9Y6J8 313 aa25.96■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 ANKRD63C9JTQ0 380 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 P4HA2O15460 535 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 MMP3P08254 477 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 ADSSP30520 456 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 FCGRTP55899 365 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 USP37Q86T82 979 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 BICD1Q96G01 975 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa25.95■■□□□ 1.75
RRP9-201ENST00000232888 PMM2O15305 246 aa25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 CCDC175P0C221 793 aa25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 FMO5P49326 533 aa25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 CAPSQ13938 189 aa25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 TFDP1Q14186 410 aa25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 BAP1Q92560 729 aa25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 USP27XA6NNY8 438 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 TISP43B9A030 160 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 NOL4O94818 638 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 CYP2B6P20813 491 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 LIG4P49917 911 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 VAMP7P51809 220 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 PTPN14Q15678 1187 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 SLC39A4Q6P5W5 647 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 WDR59Q6PJI9 974 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 POMGNT1Q8WZA1 660 aa25.94■■□□□ 1.74
RRP9-201ENST00000232888 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms