RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 TBX20Q9UMR3 447 aa25.29■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 A0A087WZ62 844 aa25.28■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 IKBKBO14920 756 aa25.28■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.28■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.28■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 BICDL2A1A5D9 508 aa25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 SMTNL1A8MU46 457 aa25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 H0YCG3 227 aa25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 GPC3P51654 580 aa25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 PTGISQ16647 500 aa25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 ACCSQ96QU6 501 aa25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
USF2-201ENST00000222305 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 NLRP7Q8WX94 980 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 WNT8BQ93098 351 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 HVCN1Q96D96 273 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TGFB1I1O43294 461 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 GJA8P48165 433 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 KIZQ2M2Z5 673 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 SPATA1Q5VX52 437 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TAF2Q6P1X5 1199 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 SERINC5Q86VE9 423 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 SCLT1Q96NL6 688 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TSG101Q99816 390 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 FANCLQ9NW38 375 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 GINS2Q9Y248 185 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 USP20Q9Y2K6 914 aa25.26■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 K7ERI5 159 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 EDN1P05305 212 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 PTENP60484 403 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 LRRC63Q05C16 580 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 HSD3B7Q9H2F3 369 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TMEM134Q9H6X4 195 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TMEM206Q9H813 350 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TISP43B9A030 160 aa25.24■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 ARVCFO00192 962 aa25.24■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 GPR32O75388 356 aa25.24■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 PHKA2P46019 1235 aa25.24■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 STRN3Q13033 797 aa25.24■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 GBP3Q9H0R5 595 aa25.24■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 CDHR5Q9HBB8 845 aa25.24■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 PDXKO00764 312 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 CLIC2O15247 247 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 B4GALT4O60513 344 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 EFNA5P52803 228 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 ZNF410Q86VK4 478 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 KCNN1Q92952 543 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 ADAMTS10Q9H324 1103 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 NOD1Q9Y239 953 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 ABCD1P33897 745 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 MBTD1Q05BQ5 628 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 POU5F1BQ06416 359 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 BICD1Q96G01 975 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 OSMRQ99650 979 aa25.23■■□□□ 1.63
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USF2-201ENST00000222305 NFKBIZQ9BYH8 718 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.23■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.22■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 PRKCBP05771 671 aa25.22■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 IQCF3P0C7M6 154 aa25.22■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 SCP2P22307 547 aa25.22■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.22■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 NME8Q8N427 588 aa25.22■■□□□ 1.63
USF2-201ENST00000222305 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25.22■■□□□ 1.63
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