RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000025301.3

AKAP11-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP11, Length 9,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11-201ENST00000025301 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 MASTLQ96GX5 879 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 FAM205AQ6ZU69 1335 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 MAP2K7O14733 419 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 FGRP09769 529 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 GARTP22102 1010 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 IRAK1P51617 712 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 ARL13BQ3SXY8 428 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 LRRC39Q96DD0 335 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 BCL9LQ86UU0 1499 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 USP17L3A6NCW0 530 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 USP17L4A6NCW7 530 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 A6NJR5 290 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 XKR9Q5GH70 373 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 USP17L1Q7RTZ2 530 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 NLRP14Q86W24 1093 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 GPATCH11Q8N954 259 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 GMCL1Q96IK5 515 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 PSTPIP1O43586 416 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 STMN1P16949 149 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 ARL4AP40617 200 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 COASYQ13057 564 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 RSPH3Q86UC2 560 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 CCDC126Q96EE4 140 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 CD209Q9NNX6 404 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 APEX2Q9UBZ4 518 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 C19orf81C9J6K1 198 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 K7ERI5 159 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 DNA2P51530 1060 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 ZNF543Q08ER8 600 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 PICALMQ13492 652 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 ARHGEF16Q5VV41 709 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 LCA5Q86VQ0 697 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 SDR42E1Q8WUS8 393 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 CYTH2Q99418 400 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 EHD2Q9NZN4 543 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 M0QZ92 97 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 MAGEB2O15479 319 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 CFBP00751 764 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 PSMD7P51665 324 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 PPM1KQ8N3J5 372 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 PYROXD1Q8WU10 500 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 FAR2Q96K12 515 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 KCNK16Q96T55 309 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 PAGR1Q9BTK6 254 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 EPC1Q9H2F5 836 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 SERPINA10Q9UK55 444 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 IL18RAPO95256 599 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 CHGBP05060 677 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 NCAPHQ15003 741 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 NTRK3Q16288 839 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 SLC15A2Q16348 729 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 CEP55Q53EZ4 464 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 KLC3Q6P597 504 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 USP38Q8NB14 1042 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 JADE3Q92613 823 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 RRN3Q9NYV6 651 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 GYPCP04921 128 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 LSP1P33241 339 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 STAT3P40763 770 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 VAMP7P51809 220 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 KRT81Q14533 505 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 SEC23AQ15436 765 aa4.8□□□□□ -1.64
AKAP11-201ENST00000025301 P3H1Q32P28 736 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms