RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn1r209Q5NC97 312 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Scnn1aQ61180 699 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam20aQ8CID3 541 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Akr1c14Q91WT7 323 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rfc4Q99J62 364 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ing2Q9ESK4 281 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slfn1Q9Z0I7 337 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Psmd10Q9Z2X2 231 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Stat3P42227 770 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Usp10P52479 792 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sdf4Q61112 361 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Krt31Q61765 416 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PrcpQ7TMR0 491 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm5622Q810Q0 167 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Phactr3Q8BYK5 558 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Thumpd2Q9CZB3 528 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem206Q9D771 350 aa9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Abt1Q9QYL7 269 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ino80Q6ZPV2 1559 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc35g2D3YVE8 412 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdk4P30285 303 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Akr1b1P45376 316 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vamp7P70280 220 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam193bQ3U2K0 892 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Skap2Q3UND0 358 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ptk6Q64434 451 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ap3m2Q8R2R9 418 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gpsm2Q8VDU0 679 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 IydQ9DCX8 285 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PigoQ9JJI6 1093 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sertad1Q9JL10 236 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dnajc12Q9R022 198 aa9.9□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nlrp1bA1Z198 1177 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm5795E9PZN8 263 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Man1a2P39098 641 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Faf1P54731 649 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Atp9bP98195 1146 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ctdnep1Q3TP92 244 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cfap52Q5F201 620 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Heatr9Q5QNV8 569 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lca5Q80ST9 704 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Scrn2Q8VCA8 425 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tc2nQ91XT6 489 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 TarsQ9D0R2 722 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klra10Q9R1G6 266 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem2Q5FWI3 1383 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gbp4A4UUI3 631 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 DtnbO70585 659 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 ScocQ78YZ6 125 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ric8bQ80XE1 520 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ces1fQ91WU0 561 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klhl41A2AUC9 606 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfp839E9PUU5 921 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm20721E9Q2U8 318 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kcnn2P58390 839 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Psmc1P62192 440 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Edem3Q2HXL6 931 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tatdn3Q3U1C6 294 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Odr4Q4PJX1 447 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gramd1bQ80TI0 738 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sept9Q80UG5 583 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mterf4Q8BVN4 346 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Knl1Q66JQ7 1612 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 StrnO55106 780 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 YwhahP68510 246 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Foxn3Q499D0 457 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 FtoQ8BGW1 502 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trim35Q8C006 501 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ulbp1Q8HWA3 334 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zswim7Q9CWQ2 152 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Snx5Q9D8U8 404 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Stk32bQ9JJX8 414 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ak9G3UYQ4 1894 aa9.89□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mgat1P27808 447 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lig1P37913 916 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam92bQ3V2J0 292 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Arhgap30Q640N3 1101 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Senp6Q6P7W0 1132 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tdpoz2Q717B2 364 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Polr3fQ921X6 316 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 DtnaQ9D2N4 746 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sgpp1Q9JI99 430 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trpc4Q9QUQ5 974 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Akap17bA2A3V1 959 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3371F7CQW8 167 aa9.88□□□□□ -0.83
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Psmc5P62196 406 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.4 ms