RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM189B	P81408	668 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	CUL4A	Q13619	759 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	FERMT3	Q86UX7	667 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF149	Q8NC42	400 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF169	Q8NCN4	708 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	SKI	P12755	728 aa		18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	MUT	P22033	750 aa		18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHKA2	P46019	1235 aa		18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRT79	Q5XKE5	535 aa		18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLVAP	Q9BX97	442 aa		18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	AAAS	Q9NRG9	546 aa		18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0U1RQF3	1178 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	EOMES	O95936	686 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRPH	P41219	470 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	GATM	P50440	423 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	POTEG	Q6S5H5	508 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	THEG	Q9P2T0	379 aa		18.43	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL4A6	Q14031	1691 aa		18.42	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		18.42	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERLIN2	O94905	339 aa		18.42	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	FGFR1	P11362	822 aa		18.42	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		18.42	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	BRAP	Q7Z569	592 aa		18.42	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		18.42	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		18.42	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		18.42	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARL2	P36404	184 aa		18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PADI6	Q6TGC4	694 aa		18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		18.41	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB27A	P51159	221 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTEN	P60484	403 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	POU5F1B	Q06416	359 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	AAK1	Q2M2I8	961 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	P2RX5	Q93086	422 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	PGBD4	Q96DM1	585 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	COG5	Q9UP83	839 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNM3	Q9UQ16	869 aa		18.4	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	BMP15	O95972	392 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP11B2	P19099	503 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSCB	Q8IWL3	235 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	HLA-C	Q95604	372 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		18.39	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	DLL1	O00548	723 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00271	P0C7V0	271 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAG3	P18627	525 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	GLRA2	P23416	452 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	AXL	P30530	894 aa		18.38	■□□□□ 0.53
JMJD1C-211	ENST00000633035	CAPS	Q13938	189 aa		18.38	■□□□□ 0.53

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