RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 GSTA4O15217 222 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TKFCQ3LXA3 575 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 HIP1RO75146 1068 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TBK1Q9UHD2 729 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 A8MXQ7 604 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ZMYND10O75800 440 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 STAT5BP51692 787 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 EPHA7Q15375 998 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ADORA2BP29275 332 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CDC27P30260 824 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 KCNJ6P48051 423 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 GPD1LQ8N335 351 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TTC13Q8NBP0 860 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SCARF1Q14162 830 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CREB3O43889 395 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 TDP2O95551 362 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 GPC5P78333 572 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 GNGT2O14610 69 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 EFNA5P52803 228 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 KCNH2Q12809 1159 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 FGD4Q96M96 766 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 PLS3P13797 630 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 AP3M2P53677 418 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 EXT2Q93063 718 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SAAL1Q96ER3 474 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 MFAP3LO75121 409 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ENTPD3O75355 529 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 TAC1P20366 129 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 GNA15P30679 374 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 KRT39Q6A163 491 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 YAF2Q8IY57 180 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 GGA3Q9NZ52 723 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 APOEP02649 317 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 40.7
CTDP1-208ENST00000613122 FGGP02679 453 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SLCO1A2P46721 670 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CDC42EP1Q00587 391 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CEP55Q53EZ4 464 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 HEY1Q9Y5J3 304 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 FLT1P17948 1338 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 RNF149Q8NC42 400 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CA4P22748 312 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 SPDL1Q96EA4 605 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 LGALS16A8MUM7 142 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ACCSLQ4AC99 568 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 FMO2Q99518 471 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CAMTA2O94983 1202 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 RALAP11233 206 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 PRCPP42785 496 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 CASP1P29466 404 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 DRP2Q13474 957 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDP1-208ENST00000613122 RASGRF2O14827 1237 aa21.54■■□□□ 1.04
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