RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 TAF3Q5VWG9 929 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 KBTBD3Q8NAB2 608 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 FGF14Q92915 247 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 TMEM169Q96HH4 297 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 KLHL5Q96PQ7 755 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 VN1R3Q9BXE9 311 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 NACAP1Q9BZK3 213 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 UBA5Q9GZZ9 404 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 NAPBQ9H115 298 aa13.42□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 CFAP46Q8IYW2 2715 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 GIPC1O14908 333 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 CD72P21854 359 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 KRT76Q01546 638 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 SLC44A4Q53GD3 710 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 SCNM1Q9BWG6 230 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 CHRDQ9H2X0 955 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ANAPC4Q9UJX5 808 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 MYO18BQ8IUG5 2567 aa13.41□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 FIBPO43427 364 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 HRO43593 1189 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 RPS6KA5O75582 802 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 KIF20AO95235 890 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 CAPNS1P04632 268 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 BCAR1P56945 870 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 IGBP1P78318 339 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 GNPTABQ3T906 1256 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ADGRF4Q8IZF3 695 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 SENP7Q9BQF6 1050 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 MAN1C1Q9NR34 630 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.262e-25■□□□□ 10.5
HCG18-241ENST00000602290 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.4□□□□□ -0.26
HCG18-241ENST00000602290 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 INPPL1O15357 1258 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 LILRB3O75022 631 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 CNPP09543 421 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 INSRRP14616 1297 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 MCM4P33991 863 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 SP4Q02446 784 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 FAM228AQ86W67 206 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 PROSER1Q86XN7 944 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 TMEM87AQ8NBN3 555 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 IGSF21Q96ID5 467 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa13.39□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 ZNF462Q96JM2 2506 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 SPTA1P02549 2419 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 DYNC1I1O14576 645 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 STAM2O75886 525 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 ZNF806P0C7X5 589 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 DMTNQ08495 405 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 PARM1Q6UWI2 310 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 NME8Q8N427 588 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 IER2Q9BTL4 223 aa13.38□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 F5P12259 2224 aa13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 NCAM2O15394 837 aa13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 RFPL2O75678 378 aa13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 TPRG1Q6ZUI0 275 aa13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 ABI1Q8IZP0 508 aa13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 SAMD3Q8N6K7 520 aa13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 NELL2Q99435 816 aa13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 PCYT2Q99447 389 aa13.37□□□□□ -0.27
HCG18-241ENST00000602290 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms