RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGAP8P85298 464 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGAP1Q07960 439 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 NR5A1Q13285 461 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 NPY5RQ15761 445 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 DUSP6Q16828 381 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PRR16Q569H4 304 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 AFG1LQ8WV93 481 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 POF1BQ8WVV4 589 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 NR2E1Q9Y466 385 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 NFASCO94856 1347 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PER2O15055 1255 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 GAS7O60861 476 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 SP9P0CG40 484 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 SFNP31947 248 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 SHC2P98077 582 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 KRT76Q01546 638 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CALCRLQ16602 461 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 TTC38Q5R3I4 469 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 METTL7BQ6UX53 244 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 C7orf31Q8N865 590 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 RDM1Q8NG50 284 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 IL31RAQ8NI17 732 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 OXER1Q8TDS5 423 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 SEPT8Q92599 483 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 TNFRSF25Q93038 417 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PGBD1Q96JS3 809 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 RIT2Q99578 217 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 POMKQ9H5K3 350 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 TLE6Q9H808 572 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CFAP45Q9UL16 551 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 DGKIO75912 1065 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 GGPS1O95749 300 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ITGB5P18084 799 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ATP2B1P20020 1258 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PMLP29590 882 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 THPOP40225 353 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PSEN2P49810 448 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 JAK3P52333 1124 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 LMNB2Q03252 620 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 DMWDQ09019 674 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 DGKDQ16760 1214 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PPM1JQ5JR12 505 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PPTC7Q8NI37 304 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 ERMNQ8TAM6 284 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 SPATA33Q96N06 139 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 MBOAT7Q96N66 472 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 AZI2Q9H6S1 392 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 MTMR6Q9Y217 621 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 COL4A3Q01955 1670 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 FSD2A1L4K1 749 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 WDR64B1ANS9 1081 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 FAM86B1E9PN63 330 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 FSCN2O14926 492 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PPFIA4O75335 1185 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 F13A1P00488 732 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 PROS1P07225 676 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-208ENST00000597576 OR52Z1P0C646 297 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms