RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591107.6

NPC1-212, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 3

Gene NPC1, Length 890 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-212	ENST00000591107	RCAN1	P53805	252 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	AIFM3	Q96NN9	605 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	MAP7D2	Q96T17	732 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TCF25	Q9BQ70	676 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	DISC1	Q9NRI5	854 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	WDR64	B1ANS9	1081 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	LAG3	P18627	525 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	CA8	P35219	290 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TEC	P42680	631 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	MRE11	P49959	708 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	GPC3	P51654	580 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	MTERF2	Q49AM1	385 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	PRSS33	Q8NF86	280 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	AAAS	Q9NRG9	546 aa		14.93	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM221	A6NGB7	291 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107		M0R296	226 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	GAS7	O60861	476 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	WEE2	P0C1S8	567 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	CIITA	P33076	1130 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	LRRC43	Q8N309	656 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	NLRP7	Q8WX94	980 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	LPP	Q93052	612 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	FAM167A	Q96KS9	214 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		14.92	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	PIEZO1	Q92508	2521 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	GNA11	P29992	359 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	FAM189B	P81408	668 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	UBE3A	Q05086	875 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	STK3	Q13188	491 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	RABEP1	Q15276	862 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	POTEG	Q6S5H5	508 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ABI1	Q8IZP0	508 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TBCK	Q8TEA7	893 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	SUSD6	Q92537	303 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	EDA	Q92838	391 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	SLC5A5	Q92911	643 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF558	Q96NG5	402 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		14.91	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ZMYND10	O75800	440 aa		14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	NLRP5	P59047	1200 aa		14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ZXDA	P98168	799 aa		14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ODR4	Q5SWX8	454 aa		14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	KANK3	Q6NY19	840 aa		14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	KSR1	Q8IVT5	923 aa		14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
NPC1-212	ENST00000591107	MAGEB2	O15479	319 aa		14.89	□□□□□ -0.03
NPC1-212	ENST00000591107	B4GALT3	O60512	393 aa		14.89	□□□□□ -0.03
NPC1-212	ENST00000591107	STBD1	O95210	358 aa		14.89	□□□□□ -0.03
NPC1-212	ENST00000591107	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
NPC1-212	ENST00000591107	IFNAR1	P17181	557 aa		14.89	□□□□□ -0.03
NPC1-212	ENST00000591107	KCNC3	Q14003	757 aa		14.89	□□□□□ -0.03
NPC1-212	ENST00000591107	TMC7	Q7Z402	723 aa		14.89	□□□□□ -0.03
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
NPC1-212	ENST00000591107	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		14.89	□□□□□ -0.03
NPC1-212	ENST00000591107	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		14.89	□□□□□ -0.03
NPC1-212	ENST00000591107	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03

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