RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 DARSP14868 501 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 MUTP22033 750 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL2P36404 184 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 GRB10Q13322 594 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC39A14Q15043 492 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 STK38Q15208 465 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB30Q15771 203 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 USP49Q70CQ1 688 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNK18Q7Z418 384 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TOP1MTQ969P6 601 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TIFAQ96CG3 184 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CALML4Q96GE6 196 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 EPSTI1Q96J88 318 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RAD9AQ99638 391 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CSRNP2Q9H175 543 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF576Q9H609 170 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CERS4Q9HA82 394 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TCHHQ07283 1943 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 LCHNA4D1U4 455 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SFI1A8K8P3 1242 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SPTLC2O15270 562 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 GJB5O95377 273 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CA3P07451 260 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP11B2P19099 503 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 GLRA2P23416 452 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TFDP1Q14186 410 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR153Q6NV75 609 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF410Q86VK4 478 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF149Q8NC42 400 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RASSF8Q8NHQ8 419 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 AK8Q96MA6 479 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS18Q9NS28 235 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 MTMR10Q9NXD2 777 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 INSL6Q9Y581 213 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RFXAPO00287 272 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF15O94989 841 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 BRD1O95696 1058 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 PLA2G4BP0C869 781 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 STAG3L1P0CL83 205 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 LIG1P18858 919 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 PHKA2P46019 1235 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 PTENP60484 403 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM189BP81408 668 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TAP1Q03518 808 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CAPSQ13938 189 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 MCM6Q14566 821 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 DSC3Q14574 896 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIN2CQ14957 1233 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 LONRF3Q496Y0 759 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 HYIQ5T013 277 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF169Q8NCN4 708 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 MCPH1Q8NEM0 835 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CPB2Q96IY4 423 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 YME1L1Q96TA2 773 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms