RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587009.5

UBXN6-203, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 1,967 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-203ENST00000587009 GDF3Q9NR23 364 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 WDR90Q96KV7 1748 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 K7ENM7 598 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 AGPSO00116 658 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 ALAS1P13196 640 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 RFX1P22670 979 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 GGCXP38435 758 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 DNA2P51530 1060 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 MYL7Q01449 175 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 USP38Q8NB14 1042 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 ZBTB9Q96C00 473 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 HINFPQ9BQA5 517 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 PNMA2Q9UL42 364 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 KCNK3O14649 394 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TRIM49P0CI25 452 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TRIM49CP0CI26 452 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 KRT13P13646 458 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 RARRES1P49788 294 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TNNC1P63316 161 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 MTMR1Q13613 665 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TNFAIP1Q13829 316 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 CPXCR1Q8N123 301 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 ACCSQ96QU6 501 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TIPINQ9BVW5 301 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 CLSTN1O94985 981 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 PLS3P13797 630 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TEPSINQ96N21 525 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 GPR88Q9GZN0 384 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 GLI1P08151 1106 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 ALS2CLQ60I27 953 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 KRT12Q99456 494 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 SYT11Q9BT88 431 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 SAMM50Q9Y512 469 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 ACTN2P35609 894 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 P4HA2O15460 535 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 CAPN2P17655 700 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 GALCP54803 685 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 PAK2Q13177 524 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 PLS1Q14651 629 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 PEX26Q7Z412 305 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 C4orf19Q8IY42 314 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 EGFRP00533 1210 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 TMEM253P0C7T8 217 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 PGM5Q15124 567 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 LMO3Q8TAP4 145 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 SCFD2Q8WU76 684 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 NCANO14594 1321 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-203ENST00000587009 MAPK13O15264 365 aa22.27■■□□□ 1.15
UBXN6-203ENST00000587009 ZBED4O75132 1171 aa22.27■■□□□ 1.15
UBXN6-203ENST00000587009 FDX1P10109 184 aa22.27■■□□□ 1.15
UBXN6-203ENST00000587009 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
UBXN6-203ENST00000587009 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
UBXN6-203ENST00000587009 GTF2BQ00403 316 aa22.27■■□□□ 1.15
UBXN6-203ENST00000587009 GUCY2DQ02846 1103 aa22.27■■□□□ 1.15
UBXN6-203ENST00000587009 CETN1Q12798 172 aa22.27■■□□□ 1.15
UBXN6-203ENST00000587009 ZSCAN26Q16670 478 aa22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.9 ms