RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 HELQQ8TDG4 1101 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 ARID2Q68CP9 1835 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 PIEZO1Q92508 2521 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 TECP42680 631 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 CDC42EP1Q00587 391 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 NHLH1Q02575 133 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 GALNT17Q6IS24 598 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 AIFM3Q96NN9 605 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 S1PR5Q9H228 398 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM221A6NGB7 291 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 M0R296 226 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 DNM2P50570 870 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 ZXDAP98168 799 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.072e-7■■□□□ 12.9
TRAF4-216ENST00000586813 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 TMC7Q7Z402 723 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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TRAF4-216ENST00000586813 A0A087WZ62 844 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 SLC37A4O43826 429 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 STK3Q13188 491 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 ANO5Q75V66 913 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF410Q86VK4 478 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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TRAF4-216ENST00000586813 BCAR1P56945 870 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 INF2Q27J81 1249 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 APOL5Q9BWW9 433 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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TRAF4-216ENST00000586813 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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TRAF4-216ENST00000586813 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 NLRP4Q96MN2 994 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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TRAF4-216ENST00000586813 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.71■■□□□ 1.07
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TRAF4-216ENST00000586813 PPP2R5CQ13362 524 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 KSR1Q8IVT5 923 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 LPPQ93052 612 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM169Q96HH4 297 aa21.71■■□□□ 1.07
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TRAF4-216ENST00000586813 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
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TRAF4-216ENST00000586813 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.7■■□□□ 1.06
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TRAF4-216ENST00000586813 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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TRAF4-216ENST00000586813 CDH22Q9UJ99 828 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAF4-216ENST00000586813 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAF4-216ENST00000586813 CDKL5O76039 1030 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAF4-216ENST00000586813 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAF4-216ENST00000586813 CA8P35219 290 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAF4-216ENST00000586813 RAB27AP51159 221 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAF4-216ENST00000586813 SCRN1Q12765 414 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAF4-216ENST00000586813 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAF4-216ENST00000586813 LONRF3Q496Y0 759 aa21.69■■□□□ 1.06
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