RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 KIFAP3Q92845 792 aa34.78■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 CUEDC2Q9H467 287 aa34.78■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 KBTBD4Q9NVX7 518 aa34.78■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 SFI1A8K8P3 1242 aa34.77■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 GIT2Q14161 759 aa34.77■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 LONRF3Q496Y0 759 aa34.77■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF710Q8N1W2 664 aa34.77■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 TIPINQ9BVW5 301 aa34.77■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 DARSP14868 501 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 CD52P31358 61 aa34.76■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 CDC42EP1Q00587 391 aa34.76■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa34.76■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa34.76■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 DYMQ7RTS9 669 aa34.76■■■■□ 3.16
GIPC1-205ENST00000586027 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 FAM228AQ86W67 206 aa34.75■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 DBF4BQ8NFT6 615 aa34.75■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 DDX12PQ92771 950 aa34.75■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 TNMDQ9H2S6 317 aa34.75■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 MINDY3Q9H8M7 445 aa34.75■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 SQORQ9Y6N5 450 aa34.75■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 SLFN14P0C7P3 912 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 FGFR4P22455 802 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM240Q5SV17 173 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF365Q70YC5 407 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 DNAJC19Q96DA6 116 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 DRC1Q96MC2 740 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP34.74■■■■□ 3.154e-8■■■■■ 33.1
GIPC1-205ENST00000586027 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 KRT18P05783 430 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PTENP60484 403 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 TFDP1Q14186 410 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 ENGASEQ8NFI3 743 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 KIFC3Q9BVG8 833 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 ODF2LQ9ULJ1 636 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PADI3Q9ULW8 664 aa34.74■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 LRRIQ4A6NIV6 560 aa34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 RPS6KA5O75582 802 aa34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PFKMP08237 780 aa34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 LIG1P18858 919 aa34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 USP38Q8NB14 1042 aa34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 MAGEF1Q9HAY2 307 aa34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 ERVK-5Q9HDB9 667 aa34.73■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF202O95125 648 aa34.72■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 CASP1P29466 404 aa34.72■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 NAMPTP43490 491 aa34.72■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PEX3P56589 373 aa34.72■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 POU5F1BQ06416 359 aa34.72■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 C9orf50Q5SZB4 431 aa34.72■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 CEP57L1Q8IYX8 460 aa34.72■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa34.72■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 AFMP43652 599 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PHKA2P46019 1235 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 NPTX2P47972 431 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF131P52739 623 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PAK2Q13177 524 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 CNKSR3Q6P9H4 555 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 CHRDL2Q6WN34 429 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 SEPT8Q92599 483 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PAGE5Q96GU1 130 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 IFT74Q96LB3 600 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 GBP4Q96PP9 640 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 TRIM9Q9C026 710 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PRO3102Q9H379 93 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 USP25Q9UHP3 1055 aa34.71■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PLS3P13797 630 aa34.7■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 FAM160A1Q05DH4 1040 aa34.7■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 OTOP2Q7RTS6 562 aa34.7■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa34.7■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 NFKBIZQ9BYH8 718 aa34.7■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 TMX1Q9H3N1 280 aa34.7■■■■□ 3.15
GIPC1-205ENST00000586027 FAM13AO94988 1023 aa34.69■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 FGBP02675 491 aa34.69■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 UBE2HP62256 183 aa34.69■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 MBTD1Q05BQ5 628 aa34.69■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 PPP2R5AQ15172 486 aa34.69■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 KRBA2Q6ZNG9 492 aa34.69■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 BLZF1Q9H2G9 400 aa34.69■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 TBCAO75347 108 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 NR1I2O75469 434 aa34.68■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 DEPTORQ8TB45 409 aa34.68■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 C7orf25Q9BPX7 421 aa34.68■■■■□ 3.14
GIPC1-205ENST00000586027 ZHX3Q9H4I2 956 aa34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms