RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 H3BQV1 296 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 WNT7AO00755 349 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 MAP3K13O43283 966 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 SLITRK3O94933 977 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRM-214ENST00000583153 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
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PTPRM-214ENST00000583153 CEP89Q96ST8 783 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRM-214ENST00000583153 A0A0U1RQF3 1178 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 ERLIN2O94905 339 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRM-214ENST00000583153 SKIP12755 728 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.935e-6■□□□□ 9.7
PTPRM-214ENST00000583153 PHKA2P46019 1235 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-214ENST00000583153 RARRES1P49788 294 aa9.26□□□□□ -0.93
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