RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579589.1

RAB11FIP4-204, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RAB11FIP4, Length 618 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-204ENST00000579589 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 HCSTQ9UBK5 93 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 A0A087WZ62 844 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 ASAP2O43150 1006 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 DGKIO75912 1065 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 BMP15O95972 392 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 IL17AQ16552 155 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 EPC2Q52LR7 807 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 KRT79Q5XKE5 535 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 POTEGQ6S5H5 508 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 KSR1Q8IVT5 923 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 NLRP4Q96MN2 994 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 RGS18Q9NS28 235 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 RNF19AQ9NV58 838 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 NCOR1O75376 2440 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 A0A087WWV3 80 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 STAG3L1P0CL83 205 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 FGFR4P22455 802 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 C9IYK1 514 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 MTMR6Q9Y217 621 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 DLL1O00548 723 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 STX6O43752 255 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 TFF2Q03403 129 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 RESTQ13127 1097 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 TMEM192Q8IY95 271 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 PP2D1A8MPX8 630 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 ARL2P36404 184 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 ECM1Q16610 540 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 RNF149Q8NC42 400 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 SAMD11Q96NU1 681 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 CHST12Q9NRB3 414 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 DACT1Q9NYF0 836 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 PHKA2P46019 1235 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 FAM189BP81408 668 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 POU5F1BQ06416 359 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 CAMK1Q14012 370 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 TFDP1Q14186 410 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 PADI6Q6TGC4 694 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 FIBCD1Q8N539 461 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 AK8Q96MA6 479 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4-204ENST00000579589 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 H3BNC9 293 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 CYP11B2P19099 503 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 CDC25AP30304 524 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 THEGQ9P2T0 379 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 DNM3Q9UQ16 869 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 C5orf42Q9H799 3197 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 GRM6O15303 877 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 GLRA2P23416 452 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 DNAJB1P25685 340 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 PTENP60484 403 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 A0A0U1RQF3 1178 aa22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP4-204ENST00000579589 EYA4O95677 639 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms