RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	SKI	P12755	728 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJB1	P25685	340 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE3A	Q05086	875 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	CAMK1	Q14012	370 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	NEK9	Q8TD19	979 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM143	Q96AN5	459 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	CASD1	Q96PB1	797 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	MTMR9	Q96QG7	549 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	CWH43	Q9H720	699 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		10.5	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	WNT7A	O00755	349 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	FGF18	O76093	207 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	LYPLA2	O95372	231 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	LAG3	P18627	525 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	MCM7	P33993	719 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	IRS1	P35568	1242 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	HYAL1	Q12794	435 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	COL19A1	Q14993	1142 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	MTR	Q99707	1265 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF19A	Q9NV58	838 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		10.49	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	REV3L	O60673	3130 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	PHKA2	P46019	1235 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT17	Q04695	432 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAM15	Q13444	863 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	EMC2	Q15006	297 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	RABEP1	Q15276	862 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF174	Q15697	407 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC43	Q8N309	656 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	PGBD4	Q96DM1	585 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF558	Q96NG5	402 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	TLE6	Q9H808	572 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	EVPL	Q92817	2033 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		10.48	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WWV3	80 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	ST18	O60284	1047 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF623	O75123	536 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	DGAT1	O75907	488 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	IL9	P15248	144 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	LTBR	P36941	435 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	TEC	P42680	631 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	NRIP1	P48552	1158 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB27A	P51159	221 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	ERVFC1	P60507	584 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	TFDP1	Q14186	410 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	FERMT3	Q86UX7	667 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF149	Q8NC42	400 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73

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