RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 DGAT1O75907 488 aa19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 MUTP22033 750 aa19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTRQ99707 1265 aa19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 BACH2Q9BYV9 841 aa19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 STK24Q9Y6E0 443 aa19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0U1RQF3 1178 aa19.06■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 GJB2P29033 226 aa19.06■□□□□ 0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP19.06■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 HAUS3Q68CZ6 603 aa19.06■□□□□ 0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 H3BQV1 296 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 EOMESO95936 686 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 SKIP12755 728 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPA1P27694 616 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 TECP42680 631 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 RARRES1P49788 294 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 POU5F1BQ06416 359 aa19.05■□□□□ 0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ECHDC2Q86YB7 292 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM143Q96AN5 459 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 NACC1Q96RE7 527 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM117Q9H0C3 514 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFT122Q9HBG6 1241 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 AAASQ9NRG9 546 aa19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBKBP1A7MCY6 615 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB39O15060 712 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHKA2P46019 1235 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDIA5Q14554 519 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCTP1Q6DN14 999 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 CATSPER4Q7RTX7 472 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 CATSPER3Q86XQ3 398 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 KSR1Q8IVT5 923 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 C4orf32Q8N8J7 132 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 HLA-CQ95604 372 aa19.04■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCOR1O75376 2440 aa19.03■□□□□ 0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB27AP51159 221 aa19.03■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 TFDP1Q14186 410 aa19.03■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM102BQ5T8I3 360 aa19.03■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABI1Q8IZP0 508 aa19.03■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa19.03■□□□□ 0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa19.03■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 MED24O75448 989 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGFR1P11362 822 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 GATMP50440 423 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTGDRQ13258 359 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC43Q8N309 656 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF149Q8NC42 400 aa19.02■□□□□ 0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PIGOQ8TEQ8 1089 aa19.02■□□□□ 0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRWD1Q9UFC0 647 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLAGL2Q9UPG8 496 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa19.02■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA1671Q9BY89 1806 aa19.02■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRM6O15303 877 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCK2O43639 380 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF623O75123 536 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 BMP1P13497 986 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAG3P18627 525 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARL2P36404 184 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBE3AQ05086 875 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 CUL4AQ13619 759 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBR1Q14596 966 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGSF22Q8N9C0 903 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASD1Q96PB1 797 aa19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
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